中新網11月13日電 臺“高檢署查黑中心”在偵結“國務機要費”后，前天火速搜索萬海航運公司保全證據，令外界錯愕。據報道，這是檢方與“總統府”斗法結果，因為承辦檢察官陳瑞仁日前曾透露，他的手機電話疑似遭“國安局”監聽。
據香港中通社報道，島內媒體引述專案小組成員透露，檢方偵辦期間，部分被吿或證人應訊前，似乎已洞悉檢方偵辦方向，并已完成串證，檢方才會顧不得尚有證據有待補強，即先起訴吳淑珍，再搜索萬海航運公司。
檢方不諱言，不少辦案人員都察覺在電話中談論的案情內容，幾天后到案的證人或被吿就已完成串證，陳瑞仁懷疑他的手機遭“國安局”監聽，因此不敢在電話里向“高檢署檢察長”謝文定報吿案情，并下令所有辦案協商，一律當面進行，同時準備和“總統府”斗法。
檢調發現，“總統府”曾利用各種方式干擾辦案。例如，陳水扁第一次接受偵訊后，“府”方便數度知會陳瑞仁，希望發布新聞證明清白，而“總統府”在陳水扁出訪返臺當天深夜，主動發布新聞證實陳水扁遭偵訊后，陳瑞仁才被動向記者證實，事后呂秀蓮還公開抨擊檢察官泄密。
此外，辦案人員認為，杏林新生制藥公司董事長李碧君等人被約談后，“總統府”里有人意圖釋放“甲君”就是龔金源的訊息，最后疑透過管道，讓國民黨“立委”李慶華知悉這項假消息并公開爆料，企圖讓外界誤認“查黑中心”和泛藍陣營掛鉤并涉嫌泄密。
據報道，在李碧君等人坦承作偽證后，陳水扁疑知悉陳瑞仁已認定他們夫婦涉及貪污，不斷要求再度說明未果，隨即展開反撲，還一度傳出企圖撤換陳瑞仁。
由于來自“府”方高層的壓力越來越大，陳瑞仁擔心案件偵查結果出問題，顧不得還有部分犯罪事實細節尚待補強，便在本月3日起訴扁嫂吳淑珍，也才會出現起訴后再搜索萬海公司保全證據的情況。
